新一代测序服务 — 454 测序及分析
罗氏诊断公司和454公司于2007年推出了通量更大,读长更长,准确性更高的第二代基因组测序系统——Genome Sequencer FLX System (GS FLX)。同Solexa相比,454的优势在于大大提高的读长,所以即便是在相同通量的情况下,成本上是Solexa的几倍,也同样有着广泛的应用。
技术特色:
◆通量:每个循环产出90~110Mb数据; - ◆平均读长250bp以上;
- ◆Picotiterplate可选(2道,4道,16道);
- ◆一个循环耗时7.5小时
应用:
◆基因组从头测序;
- ◆BAC克隆测序;
- ◆环境基因组(metagenomics)
- ◆cDNA测序
数据分析:
使用454官方拼接软件Newbler,对数据进行拼接,并结合传统比较基因组学工具,进行注释,详情请咨询 miningene@gmail.com
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